Belén fue creado por Ley 27195 como Distrito Villa Belén en el año de 2002, Belén nació a las orillas de "Belén Cocha", pequeño brazo del río Itaya que nacía por lo que hoy es la calle Itaya y desembocaba por los años de 1886 en el río Amazonas, a la altura de lo que hoy es la primera cuadra de la calle San Martín que en esa época recibía el nombre de calle Omagua.

Belén nació de abajo hacia arriba. De a pocos se fue poblando el cerro Belén, de altura gigante que sería llamada a los pocos años la Loma de Vizcarra y posteriormente Pijuayo Loma por la abundancia de aquella pa

En los pozos de Sachachorro se gesta la rebelión, las mujeres de Pijuayo Loma y del puerto son como hadas y aparece por necesidad histórica la necesidad de una mujer belenina llamada Rosa y apodada "La Capitana". Entre los días 11 y 12 de agosto organizaron marchar pero el último día se impulsó el saqueo a los comercios que previamente habían sido marcados con una cruz negra. A raíz de esto el gobierno decretó una liberación a todos los productos alimenticios de pagar los derechos de importación por un período de 6 meses hasta enero de 1909. El 13 de julio de 1915 las vendedoras de pescado encabezarán la primera huelga de la ciudad. Belén, aquella "gran callampa negra" como lo llamó el escritor Francisco Izquierdo Ríos, era ya el principal asentamiento popular en medio de la urbe iquiteña. El boom petrolero será uno de los motivos para que la demografía aumentará. En los 70 y 80 florecerán otros asentamientos poblacionales como Sachachorro ubicado a la vera de aquella mítica quebrada, también surgirán Nuevo Liberal y otros sectores de Pueblo Libre.

Octavio Tafur, es uno de los primeros moradores que concibe la idea entre tertulias, de que el populoso, mágico y rebelde barrio de Belén se convierta en Distrito. En los primeros meses de 1983 diversos vecinos comienzan a gestar la idea de formalizar dicho pedido ente el gobierno del entonces presidente Belaúnde Terry. En marzo de 1983 se constituye la COMISION COORDINADORA PRO DISTRITO DE BELEN y luego de más de una década el 5 de Noviembre de 1999 se expide la ley 27195 creándose el distrito de Villa Belén. En la actualidad el distrito cuenta con aproximadamente 74,000 habitantes y en noviembre del 2002 se eligió como Primer Alcalde del Distrito al Dr. Carlos Lozano Escudero.